目前土地收购储备机构设置的模式有两种，一种是单一结构，土地储备机构隶属土地管理部门，如上海。一种是双结构，土地收购储备委员会和土地收购储备机构，土地收购储备委员会由政府设立，成员由土地、财政、计划、规划等部门组成，任务是协调收购—储备—出让的政策，土地储备机构隶属于土地管理部门，接受收购储备委员会的领导和监督。单一机构的土地储备制度的运行，由于缺少体制和制度的保障，运行中存在很多困难，上海储备机构的同志讲“一个项目，一个故事”。从实践看，以杭州为代表的双结构的运行比较顺利。